«Устойчивость» уха – о чем этот тест говорит вам?

«Устойчивость» уха (стоячие или висячие уши), вариант chr10:11072007

У пород собак наблюдается большое разнообразие в морфологии ушей, начиная от стоячих ушей и заканчивая висячими ушами. Эти вариации в морфологии ушей, вероятнее всего, контролируются сочетанием влияний многих генетических вариаций. Поэтому нет специального генетического теста на определение типа ушей, но исследование собачьей генетики уже выявило генетические вариации в геноме, которые статистически коррелируют с фенотипом ушей. Это означает, что пока еще неоткрытая причинная мутация или вариация в геноме может находиться где-то в непосредственной близости от тестируемой вариации, с которой была установлена статистическая корреляция.

Мы тестируем однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в хромосоме 10 (CanFam2.0 chr10:11072007), между которым была выявлена связь с типом ушей в полногеномном поиске ассоциаций исследуемая в 12 породах со стоячими ушами и в 15 породах с висячими ушами. Аллель С (цитозин) этого SNP чаще всего встречается у пород собак с висячими ушами, в то время как аллель T (тимин) чаще всего встречается у пород со стоячими ушами. Пожалуйста, обратите внимание на что, что есть исключения из этого правила в наблюдаемой закономерности, и что окончательный вид вашей собаки будет зависеть от совместного влияния многих генетических факторов, влияющих на тип ушей. В настоящее время, Научно-исследовательская команда MyDogDNA работает над определением иных конформационных вариантов для тестовой панели. Основной целью является обеспечение владельцев собак наиболее полной информации и о других признаках, таких, например, как размер тела и форма черепа.

Варианты оценки результатов теста:

C/C: Ваша собака является гомозиготным (несет две копии) по генетической вариации, обычно связанной с висячими ушами. Этот генотип распространен в таких породах, как английский спрингер-спаниель, леонбергер, салюки и такса. Что интересно, C-аллель этой вариации является наследственным аллелем, часто встречающимся в волках.

         
Английский Спрингер-Спаниель   Салюки   Леонбергер
 

 

C/T: Ваша собака гетерозиготных по этой вариации. Это означает, что ваша собака несет одну копию генетической вариации, обычно связанной с висячими ушами, и одну копию, обычно связанную с стоячими ушами. Такое варьирование наблюдается во многих породах, таких как золотистый ретривер, лабрадор ретривер, и финские гончие.

Золотистый Ретривер Лабрадор Ретривер

 

T/T: Ваша собака является гомозиготным (несет две копии) по генетический вариации, обычно связанной со стоячими ушами. Этот генотип распространен в таких породах, как финский шпиц, немецкая овчарка, самоед, терьеры, и в породах, родственных колли.

Финский Шпиц Американский той-фокстерьер Самоед

 

​Vaysse A, Ratnakumar A, Derrien T, Axelsson E, Rosengren Pielberg G, Sigurdsson S, Fall T, Seppälä EH, Hansen MST, Lawley CT, Karlsson EK, The Lupa Consortium, Bannasch D, Vilà C, Lohi H, Galibert F, Fredholm M, Häggström J, Hedhammar Å, André C, Lindblad-Toh, Hitte C, Webster MT. Identification of Genomic Regions Associated with Phenotypic Variation between Dog Breeds using Selection Mapping. PLoS Genet 7(10): e1002316, 2011. Pubmed: 22022279.